2005年，中国港湾建设（集团）总公司与中国路桥（集团）总公司合并成立中国交通建设集团有限公司，2006年2月成立了中国交通建设股份有限公司总承包经营分公司，继承了原中国港湾建设（集团）总公司工贸事业部、国内事业部的全部业务,定位于“承担集团名义承接的各类总承包项目的实施和管理，组织实施BT、BOT项目经营管理，以及其他以集团名义承接的项目运作及管理”。

2013年4月，为强化中国交建机电品牌、完善产业链，中交机电工程局有限公司在中国交建总承包分公司基础上注册成立，与中国交建总承包分公司实行“两块牌子，一套人马”的模式运行。

2018年4月，为适应轨道交通市场发展需要，提升轨道交通业务专业化发展能力，中交集团依托总承包分公司的平台和资源成立轨道交通分公司，与总承包分公司按照“两块牌子、一套人马”模式运行，进一步强化总承包分公司投资、建设、运营等专业人才的培养和引进，打造其为专业从事路桥、港航等传统业务的总承包项目管理平台及轨道交通项目投资、建设、运营一体化管理平台。

2020年，中交集团暨中国交建设立国内直营业务事业部，依托总承包分公司实行公司化运作，主要承担境内直属项目管理等职能，负责境内直属项目（轨道类项目除外）的市场开发、合同履约、项目管理、统筹协调、资源配置、运营监控、统计分析等工作。同时，设立轨道交通事业部，依托轨道交通分公司实行公司化运作，机电局并入轨道交通事业部一体化管理。